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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
30/03/2016 |
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Data da última atualização: |
07/04/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANTOS, D. N.; FERREIRA, J. L.; PASQUAL, M.; GENEROSO, A. L.; SETOTAW, T. A.; CANCADO, G. M. de A.; VENDRAME, W. A. |
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Afiliação: |
D. N. Santos, UFLA; JULIANO LINO FERREIRA, CPPSUL; M. Pasqual, UFLA; A. L. Generoso, UENF; T. A. Setotaw, UFLA; GERALDO MAGELA DE ALMEIDA CANÇADO, CNPTIA; W. A. Vendrame, University of Florida. |
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Título: |
Population structure of jatropha and its implication for the breeding program. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 1, 2016. |
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DOI: |
10.4238/gmr.15017770 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Não paginado. |
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Conteúdo: |
Jatropha (Jatropha curcas L.) has potential as an oilseed crop that requires the development of technology for its exploitation. The objective of this study was to assess the population structure and the genetic diversity in jatropha accessions at a global level using simple sequence repeat (SSR) molecular markers. |
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Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Physic nut; Variedade genética. |
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Thesagro: |
DNA; Jatropha Curcas; Marcador genético; Marcador molecular; Melhoramento genético vegetal. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic markers; Genetic variation. |
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Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/141801/1/gmr7770.pdf
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Marc: |
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100 1 $aSANTOS, D. N.
245 $aPopulation structure of jatropha and its implication for the breeding program.$h[electronic resource]
260 $c2016
500 $aNão paginado.
520 $aJatropha (Jatropha curcas L.) has potential as an oilseed crop that requires the development of technology for its exploitation. The objective of this study was to assess the population structure and the genetic diversity in jatropha accessions at a global level using simple sequence repeat (SSR) molecular markers.
650 $aGenetic markers
650 $aGenetic variation
650 $aDNA
650 $aJatropha Curcas
650 $aMarcador genético
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650 $aMelhoramento genético vegetal
653 $aDiversidade genética
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700 1 $aPASQUAL, M.
700 1 $aGENEROSO, A. L.
700 1 $aSETOTAW, T. A.
700 1 $aCANCADO, G. M. de A.
700 1 $aVENDRAME, W. A.
773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 15, n. 1, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
19/12/2012 |
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Data da última atualização: |
30/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; REDE BIFEQUALI. |
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Afiliação: |
ADRIANA LUIZA SOMAVILLA, PÓS-GRADUAÇÃO UNESP/JABOTICAL; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001). |
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Palavras-Chave: |
Desequilíbrio de ligação; Genotipagem; REHH; Snps. |
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Thesagro: |
Bos Indicus. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/72480/1/LUCIANA2.pdf
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Marc: |
LEADER 02019nam a2200229 a 4500
001 1943057
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100 1 $aSOMAVILLA, A. L.
245 $aCaracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore.$h[electronic resource]
260 $aIn: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA$c2012
520 $aA identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001).
650 $aBos Indicus
653 $aDesequilíbrio de ligação
653 $aGenotipagem
653 $aREHH
653 $aSnps
700 1 $aHIGA, R. H.
700 1 $aMUDADU, M. de A.
700 1 $aALENCAR, M. M. de
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
700 1 $aREDE BIFEQUALI
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
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| Registros recuperados : 1 | |
| 1. |  | 6050009, IRISH VETERINARY JOURNAL, Irish Veterinary Association, Dublin-Irlanda
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Semiárido; Embrapa Suínos e Aves. |   |
| Registros recuperados : 1 | |
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